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海思安测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品

海思安测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品

  • 产品型号:360007
  • 更新时间:2020-06-11
  • 产品介绍:测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品
    【批号】360007-201401
    【性状】无色液体
  • 厂商性质:经销商
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产品介绍

测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品

测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品

 

用途】包括四种基因组 DNA 样本,分别是人基因组 DNA 样本、大肠杆菌基因组DNA 样本、高 GC 菌基因组DNA 样本、HPV 病毒基因组DNA 样本。用于一代、二代测序仪测序准确度、重复性等性能评价。

编号

名称

DNA 来源

细胞或菌种

来源

1

人全基因组DNA

炎黄细胞系

正常男性外周血白细胞构建永生细

胞系

2

大肠杆菌基

因组 DNA

DH5α感受态

培养细胞

商业购买

3

高 GC 含量细菌基因组 DNA

GC 菌培养

人肠道中分离筛选鉴定后培养厌氧

4

11 型 HPV 基

因组 DNA

11 型HPV 病毒

重组质粒

中检院制备

国家标准品

包装】1.5mL 螺口冻存管

规格】共计 36 支参考品样本,每支参考品装量 50μl。YH 正常人基因组 50ng/μLYH 正常人基因组 25ng/μL、YH 正常人基因组12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组 50ng/μL、高GC 含Olsenella 细菌基因组 25ng/μL、高 GC 含量Olsenella 细菌基因12.5ng/μL、大肠杆菌DH5a细菌基因组 50ng/μL 大肠杆菌DH5 a细菌基因组 25ng/μL、大肠杆菌DH5a细菌基因组 12.5ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 50ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组25ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 12.5ng/μL 各三支。

使用方法和要求

1. 测序通量≥10Gb/run 二代测序仪评价:YH 正常人基因组 50ng/μ LYH 正常人基因组 25ng/μLYH 正常人基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组 50ng/μL、高 GC 含量Olsenella 细菌基因组 25ng/μL、大肠杆菌DH5a细菌基因组 50ng/μL 大肠杆菌DH5 a细菌基因组 25ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 50ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 25ng/μL 各取 40μl 直接进行打断建库;人乳头瘤病毒 11 型基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因12.5ng/μL、大肠杆菌 DH5a细菌基因组 12.5ng/μL 应采用TE 稀5 倍后各取 40μl 进行打断建库。

本参考品使用时,应满足:

   测序准确性:针对人基因组 DNA 参考品使用 2ug1ug 和 500ng 起始,人基因组DNA 参考序列中 1G 参考序列测序比对,测序准确度应不低于 99.0%;针对细菌和病毒DNA 参考品使用 2ug、1ug 和100ng对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对,测序准确度应不低于99.0%。

   重复性:进行三次重复测序,要求测序准确性均能满足对人基因DNA参考序列中1G参考序列测序比对,测序准确度应不低于99.0%; 对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对,测序准确度应不低于99.0%。

   测序通量<10Gb/run 二代测序仪评价:YH 正常人基因组 50ng/μLYH 正常人基因组 25ng/μLYH 正常人基因组 12.5ng/μL、高GC 含Olsenella 细菌基因组 50ng/μL、高 GC 含量Olsenella 细菌基因25ng/μL、大肠杆菌DH5a细菌基因组 50ng/μL 大肠杆菌DH5a 细菌基因组 25ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 50ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 25ng/μL 各取 40μl 直接进行打断建库;人乳头瘤病毒 11 型基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组12.5ng/μL、大肠杆菌 DH5a细菌基因组 12.5ng/μL 应采用 TE 稀释5 倍后各取 40μl 进行打断建库。

本参考品使用时,应满足:

  • 测序准确性:针对人基因组 DNA 参考品使用 2ug1ug 和 500ng 起始,人基因组DNA 参考序列中 30Mb 全外显子参考序列测序比对, 测序准确度应不低于 99.0%;针对细菌和病毒 DNA 参考品使用 2ug1ug100ng 对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高 GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对,测序准确度应不低于 99.0%。
  • 重复性:进行三次重复测序,要求测序准确性均能满足对人基因DNA 参考序列中 30Mb 全外显子参考序列测序比对,测序准确度应不低于 99.0%;对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对,测序准确度应不低于 99.0%。
  • 一代测序仪评价:每支参考品均直接使用或采用TE 稀释后使用。根据参考品序列设计合适的扩增引物进行扩增后,进行连续 4K 序列的测序。

本参考品使用时,应满足:

1) 测序准确性:人基因组DNA 参考序列、大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列中各 4K 连续参考序列测序比对,测序准确度应不低于99.0%。

  • 重复性:进行三次重复测序,要求测序准确性均能满足人基因组DNA 参考序列、大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高 GC 含量细菌基因DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列中各 4K 连续参考序列测序比对,测序准确度应不低于 99.0%。

贮藏】-70℃储存。

注意事项

1. PCR 操作按照分区进行,使用带滤芯的枪头吸取,防止污染。稀释时应避免剧烈震荡。

2. 应于-70℃储存,避免反复冻融。

 

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